废佛毁释

神佛分离令并不是要否定佛教、寺院，也不是废佛政策，所以政府劝戒了社人的过头行动（四·十），然而实际上，各地还是相继出现了烧毁寺院、佛像，卖掉佛具、经卷的现象。政府不得不再一次发布通告以说明判然令并不是要废佛（六·二十二）。

津和野藩

津和野藩在明治政府发布神佛分离令前一年的庆应三年六月已将藩内改为神葬祭（神道式的葬仪），并对寺院实施了整顿。推进神佛分离的神祇事务局里因有藩主龟井兹监、藩士国学者福羽美静的存在，所以别的藩都仿效津和野藩。

松本藩

废佛思想较强烈的藩主户田光则，明治三年八月向政府请示了藩内神葬祭的事，这以后积极推进废夺政策，让僧侣归返农村，其做法过于强制，四年十一月户田藩知事被罢免，过激的废佛毁释行动被终止。

苗木藩

这是美浓的一个小藩，藩内流行平田国学，受复古神道的影响较强，明治三年藩主远山氏举家入平田门，第二年命令藩内废佛，领内15处寺庙全部被废，佛坛及路旁的石佛全部被毁。

富山藩

明治三年十月，根据封内合寺的命令，只限于一宗一寺，因而只剩下七宗七寺。

隐岐

庆应四年三月，岛民们驱逐了松江藩郡代等人，建立了庄屋（江户时代的村长）和神官的合议制（总会所），3个月后被松江藩以武力击溃（隐岐骚动）。明治二年三月开始废佛，岛内46座寺院全部废止，不允许僧职存在，因此佛教在岛上完全销声匿迹了。

佐渡

由幕领变为朝廷的支配地，奥平谦辅（长）上任后立即实施了大幅度的寺院合并和限制宗教活动。

无论是松本、富山两藩还是佐渡，真宗门徒的抵抗尤其强烈。围绕寺院的冲突事件不断增加，政府将民部省的社寺挂改为寺院寮，命其处理宗教事务。

兴福寺

南都七大寺中，兴福寺里以一乘院、大乘院为首僧侣全部还了俗，成了春日神社的神官。107号末寺也接到与本寺断绝关系的通知，一时此寺失去寺主，暂时隶属于西大寺、唐招提寺，明治五年诸堂被破坏，5重塔当时以250日元被卖掉，买主想烧毁以得其中金具，因遭周围町家的反对未能动手。

日吉神社等

在石清水八幡宫，别当（僧职）四家都还俗，山上的各个佛殿全部荒废了。在日吉神社（近江坂本），祠官树下茂国于庆应四年四月让几十名同志携武器闯入山王权现的神殿，烧毁了佛像、佛具。这次事件后不久，政府开始采取防暴举的措施（四·十），并给予树下以谨慎的处分。

摘自《日本近代史》 第二章 近代国家的建设  七、神祇政策和佛教界